| Grand dauphin | Tursiops truncatus | 2 011 | 2 Gb | 21 000 gènes | Premier génome de cétacé entièrement séquencé. Lindblad-Toh et al. Nature. |
| Petit rorqual | Balaenoptera acutorostrata | 2 013 | 3 Gb | 21 000 gènes | Premier génome de mysticète. Yim et al. Nature Genetics. |
| Cachalot | Physeter macrocephalus | 2 014 | 2 Gb | 22 000 gènes | Warren et al. Genome Research. Gènes du spermaceti identifiés. |
| Orque | Orcinus orca | 2 014 | 2 Gb | 21 000 gènes | Foote et al. Nature Comm. Gènes adaptation thermique. |
| Baleine bleue | Balaenoptera musculus | 2 018 | 2 Gb | 21 000 gènes | Árnason et al. Sci Adv. Hybridations historiques avec rorqual commun confirmées génétiquement. |
| Rorqual commun | Balaenoptera physalus | 2 018 | 2 Gb | 21 000 gènes | Génome publié simultanément à celui de la bleue. Évolution adaptative documentée. |
| Marsouin commun | Phocoena phocoena | 2 014 | 2 Gb | 20 000 gènes | Génome référence pour études bycatch Mer du Nord. |
| Béluga | Delphinapterus leucas | 2 017 | 2 Gb | 21 000 gènes | Jones et al. Mol Biol Evol. Adaptations arctiques. |
| Narval | Monodon monoceros | 2 019 | 2 Gb | 21 000 gènes | Génétique de la défense (dent) explorée. Diversité génétique faible. |
| Baleine à bosse | Megaptera novaeangliae | 2 019 | 2 Gb | 21 000 gènes | Reconstitution démographique post-chasse. |
| Baleine boréale | Balaena mysticetus | 2 015 | 2 Gb | 21 000 gènes | Keane et al. Cell Rep. Gènes de longévité identifiés (réparation ADN exceptionnelle). |
| Baleine grise | Eschrichtius robustus | 2 019 | 2 Gb | 21 000 gènes | Étudie les goulots d'étranglement post-chasse. |
| Vaquita | Phocoena sinus | 2 017 | 2 Gb | 20 000 gènes | Morin et al. Faible diversité génétique = absence de bottleneck récent SURPRENANT. |
| Ziphius de Cuvier | Ziphius cavirostris | 2 019 | 2 Gb | 21 000 gènes | Génétique de la plongée extrême explorée. |
| Globicéphale noir | Globicephala melas | 2 018 | 2 Gb | 21 000 gènes | Études phylogéographiques entre populations Atlantique Nord. |
| Dauphin tacheté pantropical | Stenella attenuata | 2 018 | 2 Gb | 21 000 gènes | Distinguer sous-espèces côtière vs offshore. |
| Sténelle longirostre | Stenella longirostris | 2 019 | 2 Gb | 21 000 gènes | Génétique des populations résidentes (Moorea, Rangiroa). |
| Baiji du Yang-Tsé | Lipotes vexillifer | 2 013 | 2 Gb | 20 000 gènes | Zhou et al. Génome séquencé alors que l'espèce est probablement éteinte. |
| Dauphin du Gange | Platanista gangetica | 2 018 | 2 Gb | 20 000 gènes | Études phylogéographiques avec dauphin de l'Indus. |
| Boto (dauphin Amazone) | Inia geoffrensis | 2 017 | 2 Gb | 21 000 gènes | Distinction génétique avec Inia araguaiaensis confirmée. |
| Mésoplodon de Hubbs | Mesoplodon carlhubbsi | 2 019 | 2 Gb | 20 000 gènes | Génétique des baleines à bec, taxonomie en cours de révision. |
| Hyperoodon boréal | Hyperoodon ampullatus | 2 020 | 2 Gb | 21 000 gènes | Comparaisons avec baleines à bec australes. |
| Baleine franche Atl. N. | Eubalaena glacialis | 2 020 | 2 Gb | 21 000 gènes | Goulot d'étranglement génétique extrême documenté. |
| Baleine franche australe | Eubalaena australis | 2 019 | 2 Gb | 21 000 gènes | Comparaison avec sœur Atl. N. : meilleure diversité. |
| Petit rorqual antarctique | Balaenoptera bonaerensis | 2 019 | 2 Gb | 21 000 gènes | Distinguer petits rorquals nord/sud génétiquement. |